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外源性内标和内源性内标曲线异常情况分析作者:分子检测 分子检测内标基因核酸检测试剂盒基本都已经加入“内标”,主要分为“外源性内标”和“内源性内标”两种,下面我们结合实验室经常遇到的“样本内标扩增异常”情况,在实际检测中,我们经常会遇到的“样本内标扩增异常”情况,如何解决曲线异常的问题?在质控满足要求时,如何正确的认识核酸检测中的内标基因? 常见异常内标曲线及可能原因分析➢外源性内标的异常内标曲线1. 靶基因和内标均无扩增 常见原因:无法明确是否存在检验前问题,多数为检验中内标样本错加漏加、核酸加样时错加漏加;若连续多个样本存在此情况,首先考虑提取试剂、提取仪的问题。 2. 靶基因有扩增但内标无扩增 常见原因:应先明确靶基因是否同内标基因存在竞争或抑制作用,若不存在,原因同上,且该扩增孔存在污染可能。 例图1: 典型的高浓度样本抑制内标基因扩增 图1. 靶基因有扩增但内标无扩增 3. 外源性内标基因扩增明显离散 常见原因:外源性内标**特点为均匀性好,故个别样本内标离散时多为反应体系中存在抑制物;部分连续样本内标离散时,应首先考虑提取试剂、提取仪的问题;若整板样本内标离散时,多为扩增体系配制时未充分混匀。 例图2: 该样本反应体系中存在抑制物。 图2. 单个样本内标基因离散 例图3: 由于磁珠残留、加热模块异常,造成多个连续样本内标基因离散。 图3. 多个样本内标基因离散 针对以上外源性内标曲线异常现象的应对措施: 更换试剂、耗材、仪器等条件进行复检;重新采样检测并严格按照sop操作等。 ➢内源性内标的异常内标曲线检验人员需首先明白内源性内标有扩增不代表采样成功, 原因有3点: A. 对于混采样本,只需1个受试者采样成功,内源性内标就会有扩增; B. 以RNase P内标为例,如不能正确采样,仅采集口腔甚至皮肤样本,同样会有内源性内标扩增; C. 环境中可能会存在人源性样本气溶胶污染。但是,采样不成功时,内源性内标一定无扩增。 1. 靶基因和内标均无扩增 常见原因:实验室较为常见,涉及范围较广,包括检验前样本采集、保存、运送问题;检验中反应体系、提取、扩增问题以及人员操作问题等。 2. 靶基因有扩增但内标无扩增 常见原因:情况极其少见,因内源性内标基因与靶基因通常无竞争或抑制作用,所以原因同上,且该扩增孔可能存在污染或非特异性扩增。 例图4: 采样失败且靶基因非特异性扩增。 图4. 靶基因非特异性扩增且内标无扩增 3. 内源性内标基因扩增明显离散 常见原因:由于采样质量直接影响内标扩增结果,故曲线较离散属于正常情况,并不一定是人员不规范操作引起的,所以这种情况较难界定。 例图5: 若排除检验前问题,整体内标曲线相对离散,可能由于样本未充分振荡混匀或扩增体系配制时未充分振荡混匀。 图5. 内标基因离散 针对以上内源性内标曲线异常现象的应对措施: 更换试剂、耗材、仪器等条件进行复检;重新采样检测并严格按照sop操作等。 ➢其他常见的异常内标曲线1. 曲线明显分为两簇 常见原因: A. 可能是提取仪异常导致提取效率低,多为加热模块故障、磁珠异常或磁珠残留; B. 可能所用的反应液放置时间过长导致扩增效率下降; C. 可能是不同的采样管内的保存液对提取试剂的提取效率有影响。 图6. 扩增曲线分为两簇 2. 内标曲线不平滑(靶基因曲线正常) 常见原因:多为错用扩增程序,如A试剂反应体系使用了B试剂的扩增程序,可重新选择正确的荧光通道。 图7. 内标曲线不平滑 总结 不同的内标都各有利弊,实验室应根据具体的使用需求,科学看待和选择。即“有内标不一定行,但无内标一定不行”。 核酸检测过程中的每一个操作环节都有可能影响检测结果,所以实验室必须规范化管理,出现样本内标异常结果时也应细心观察、耐心分析,采样人员采样时也应规范合理,最终保证核酸检测的质量。 美格生物部分热销试剂价格
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