转录组(Transcriptome)是指特定组织或细胞在某一功能状态下所转录出来的所有RNA(包括mRNA和非编码RNA)。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点。通过新一代高通量测序技术一次性获得研究对象的全部转录本信息，进而可用于发现该样本转录水平上的结构和数量的差异，从而对这些差异信息进行深入研究，准确地进行基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs)分析等。与传统的基因芯片技术相比，转录组测序无需预先设计芯片，便可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测，提供更精确的数字化信号、更高的检测通量和更广泛的检测范围。目前转录组测序已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

美格生物真核mRNA测序对真核生物的特定组织或细胞，在某个时期转录出来的所有mRNA测序数据进行测序，研究已知基因，挖掘新基因，全面快速地获得mRNA序列和丰度信息。真核mRNA测序方法一般基于HiSeq平台，可以分为：无参考转录组、有参考转录组和数字基因表达谱DGE三大类。