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地铁系统的环境暴露和城内和城际交通流可能对皮肤微生物和抗性产生影响

作者:Gianni Panagiotou来源:cell

广州美格生物在微生物研究领域有着丰富的经验。咨询热线:18027152056


皮肤是人体与外界环境的主要界面。为了了解微生物群落在城市轨道交通中如何变化并影响皮肤微生物群,我们对香港轨道交通(MTR)系统中的扶手接触后,人掌微生物群进行了分析研究。

香港MTR地铁系统及抽样程序

地铁系统的环境暴露和城内和城际交通流可能对皮肤微生物和抗性产生影响


本研究中使用了MTR地铁系统和八条城市线(不包括机场快线和迪斯尼乐园度假村支线)。

取样过程包括洗手、触摸扶手30分钟、抽吸样品和样品保存。

日内采样的时间被确定为群落的变化和复现的决定因素,而与人类相关的种类和临床上重要的抗生素抗性基因(ARGS)在下午被发现。

人共生体和临床ARGS在下午样品中的相对丰度较高。

特定线路特征与特定线路环境的暴露和城市特征显著相关。特定线路环境暴露也调节微生物群落。

在大部分分析中,唯一的深港跨界线作为异常值出现,并且显示出相对高的丰度,以及客观上重要的ARGs的显著日内增量(24.1%),显示潜在的跨界ARG传递,特别是对四环素和万古霉素抗性。

我们的研究为今后的公共卫生战略,以减少市内和城际病原体和ARG传输, 提供了重要的参考。

地铁系统的环境暴露和城内和城际交通流可能对皮肤微生物和抗性产生影响

MTR微生物群落的分类、系统发育、群落多样性与差异

(a)在物种水平上最丰富的物种的系统发育和相对丰度。

系统进化树是由OpenTree 7.0绘制,用分支颜色表示生物门。

地铁系统的环境暴露和城内和城际交通流可能对皮肤微生物和抗性产生影响

时间特异性和线路特征及其相对丰度

相对丰度按行缩放到Z值,由蓝色到红色,代表由低到高的相对丰度。

(a)热图显示的时间特征。

   左边颜色条的颜色指示领先的时间点。行标签颜色和标记代表领先的时间点和统计意义。

(b)744个分析种中的上午(蓝色)或下午(红色)特征种的秩分布的密度图。下午的种的分布是左偏的。

(c)线路特异性种类的数量,以及上午或下午亚组中,各自的特性ARG家族的数目。

(d)用于上午或下午子集和所有样本的线路特征的热图。

     行标签颜色表示:只是在上午或下午的子集中观察到显著性,或是在所有样品中观察到显著性。



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参考文献

The Environmental Exposures and Inner- and Intercity Traffic Flows of the Metro System May Contribute to the Skin Microbiome and Resistome

Kang Kang,Yueqiong Ni,Jun Li,Lejla Imamovic,Chinmoy Sarkar,Morten Otto Alexander Sommer,Christopher John Webster,Gianni Panagiotou   


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